Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms