Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnni3kQ5GIG6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnni3kQ5GIG6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms