Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms