Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA7

Snx33, Sorting nexin-33, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx33Q4VAA7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx33Q4VAA7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx33Q4VAA7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx33Q4VAA7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx33Q4VAA7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx33Q4VAA7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx33Q4VAA7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx33Q4VAA7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx33Q4VAA7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Snx33Q4VAA7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Snx33Q4VAA7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Snx33Q4VAA7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Snx33Q4VAA7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Snx33Q4VAA7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Snx33Q4VAA7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Snx33Q4VAA7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Snx33Q4VAA7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Snx33Q4VAA7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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