Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srek1ip1Q4V9W2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srek1ip1Q4V9W2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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