Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmat1Q3V0C1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zmat1Q3V0C1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms