Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc27Q3V036 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc27Q3V036 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc27Q3V036 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc27Q3V036 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc27Q3V036 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc27Q3V036 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc27Q3V036 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc27Q3V036 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc27Q3V036 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc27Q3V036 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc27Q3V036 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc27Q3V036 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc27Q3V036 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc27Q3V036 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc27Q3V036 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc27Q3V036 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc27Q3V036 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc27Q3V036 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc27Q3V036 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc27Q3V036 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc27Q3V036 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms