Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nhlrc4Q3UP44 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms