Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms