Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tmem253Q3UNB8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tmem253Q3UNB8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tmem253Q3UNB8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tmem253Q3UNB8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tmem253Q3UNB8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tmem253Q3UNB8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tmem253Q3UNB8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tmem253Q3UNB8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Tmem253Q3UNB8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Tmem253Q3UNB8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Tmem253Q3UNB8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Tmem253Q3UNB8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Tmem253Q3UNB8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Tmem253Q3UNB8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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