Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ankrd27Q3UMR0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd27Q3UMR0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd27Q3UMR0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd27Q3UMR0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd27Q3UMR0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd27Q3UMR0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd27Q3UMR0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd27Q3UMR0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd27Q3UMR0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd27Q3UMR0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd27Q3UMR0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd27Q3UMR0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd27Q3UMR0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd27Q3UMR0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd27Q3UMR0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd27Q3UMR0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd27Q3UMR0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd27Q3UMR0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd27Q3UMR0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd27Q3UMR0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd27Q3UMR0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms