Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULA2

Btrc, F-box/WD repeat-containing protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtrcQ3ULA2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BtrcQ3ULA2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BtrcQ3ULA2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms