Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VwceQ3U515 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms