Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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