Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms