Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrx1Q3TL44 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrx1Q3TL44 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms