Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms