Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc162pQ0VG85 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms