Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cass4Q08EC4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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