Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Calb2Q08331 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms