Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
F13bQ07968 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
F13bQ07968 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
F13bQ07968 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms