Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms