Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp2Q06649 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms