Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnal1Q05A62 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnal1Q05A62 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnal1Q05A62 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnal1Q05A62 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnal1Q05A62 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnal1Q05A62 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnal1Q05A62 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnal1Q05A62 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnal1Q05A62 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnal1Q05A62 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnal1Q05A62 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnal1Q05A62 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnal1Q05A62 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnal1Q05A62 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnal1Q05A62 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnal1Q05A62 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnal1Q05A62 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnal1Q05A62 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnal1Q05A62 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnal1Q05A62 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnal1Q05A62 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnal1Q05A62 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnal1Q05A62 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnal1Q05A62 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnal1Q05A62 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms