Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fmn1Q05860 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fmn1Q05860 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms