Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms