Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Emx2Q04744 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms