Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CkbQ04447 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CkbQ04447 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CkbQ04447 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CkbQ04447 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CkbQ04447 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CkbQ04447 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CkbQ04447 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CkbQ04447 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CkbQ04447 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CkbQ04447 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CkbQ04447 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CkbQ04447 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CkbQ04447 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CkbQ04447 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CkbQ04447 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CkbQ04447 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CkbQ04447 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CkbQ04447 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CkbQ04447 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms