Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms