Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms