Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms