Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1cQ01815 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1cQ01815 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms