Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms