Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cds1P98191 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cds1P98191 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms