Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Scn1bP97952 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Scn1bP97952 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Scn1bP97952 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Scn1bP97952 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Scn1bP97952 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn1bP97952 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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