Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited1P97769 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited1P97769 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited1P97769 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited1P97769 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited1P97769 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited1P97769 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms