Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg1P97376 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frg1P97376 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms