Protein–RNA interactions for Protein: P97326

Cdh6, Cadherin-6, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh6P97326 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdh6P97326 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdh6P97326 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdh6P97326 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdh6P97326 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdh6P97326 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms