Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccl21cP86793 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl21cP86793 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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