Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcgP82348 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcgP82348 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcgP82348 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcgP82348 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcgP82348 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcgP82348 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcgP82348 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcgP82348 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcgP82348 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcgP82348 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms