Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcdP82347 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcdP82347 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcdP82347 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcdP82347 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcdP82347 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcdP82347 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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