Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms