Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stra8P70278 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stra8P70278 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stra8P70278 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stra8P70278 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stra8P70278 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms