Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrig1P70193 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms