Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn5P68500 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn5P68500 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn5P68500 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn5P68500 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn5P68500 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn5P68500 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn5P68500 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn5P68500 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn5P68500 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn5P68500 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn5P68500 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn5P68500 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn5P68500 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn5P68500 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn5P68500 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn5P68500 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms