Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gabrb3P63080 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms