Protein–RNA interactions for Protein: P62500

Tsc22d1, TSC22 domain family protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d1P62500 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsc22d1P62500 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms