Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms