Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd38P56528 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd38P56528 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd38P56528 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cd38P56528 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd38P56528 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd38P56528 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd38P56528 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd38P56528 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cd38P56528 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd38P56528 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd38P56528 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd38P56528 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd38P56528 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd38P56528 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd38P56528 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd38P56528 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd38P56528 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd38P56528 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd38P56528 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd38P56528 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd38P56528 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd38P56528 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd38P56528 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd38P56528 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd38P56528 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd38P56528 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd38P56528 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd38P56528 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd38P56528 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd38P56528 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd38P56528 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd38P56528 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd38P56528 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd38P56528 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd38P56528 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd38P56528 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd38P56528 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd38P56528 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd38P56528 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd38P56528 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd38P56528 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd38P56528 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd38P56528 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd38P56528 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Cd38P56528 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd38P56528 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd38P56528 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd38P56528 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd38P56528 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd38P56528 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd38P56528 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd38P56528 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd38P56528 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd38P56528 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd38P56528 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd38P56528 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd38P56528 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd38P56528 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd38P56528 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd38P56528 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd38P56528 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd38P56528 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd38P56528 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd38P56528 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd38P56528 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd38P56528 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd38P56528 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd38P56528 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd38P56528 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd38P56528 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd38P56528 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cd38P56528 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd38P56528 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd38P56528 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd38P56528 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd38P56528 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd38P56528 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cd38P56528 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd38P56528 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd38P56528 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd38P56528 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd38P56528 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd38P56528 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd38P56528 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd38P56528 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd38P56528 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd38P56528 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd38P56528 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd38P56528 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd38P56528 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd38P56528 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd38P56528 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd38P56528 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd38P56528 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd38P56528 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd38P56528 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cd38P56528 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cd38P56528 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cd38P56528 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms