Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp5P56399 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp5P56399 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp5P56399 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp5P56399 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp5P56399 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms